Короче изучил вопрос, все-таки лило кажется из-под обшивки двери. Криво наклеил изоляцию под обшивку и она отклеилась в 2 местах по 5-7 см. В итоге обшивка мокла и с нее текло на уплотнитель, а с уплотнителя вниз на днище (но почему-то под ковром протекало, ковер сверху сухой).
В дождь выходил снимал водосток смотрел под фильтр - там сухо, стало быть через печку не заливает. Еще у меня по ходу протекает в кузов вода через уплотнитель бокового заднего стекла, но там немного + полость порога с днищем никак не связана - это я посмотрел. Даже если внутри порога чуть воды есть, на днище она никак не попадет.
Переделал изоляцию, посмотрим, помогло или нет :) Но я в шоке, что от пары маленьких мест, где отклеилась изоляция, может столько наливать, учитывая, что сливы в дверях не забиты.